依托单位巴彦淖尔市农牧业科学研究院建设的农业部植物新品种测试巴彦淖尔分中心于2016年完成批复并开工建设，2017年建成并开始运行。项目总投资680万元，占地约93亩，其中试验用地90亩，业务用房670平方米，农机库、晾晒棚310平方米，晒场880平方米，仪器设备及农机具197台（套、批），价值340多万元。分中心以小麦、玉米和向日葵为主要测试作物，其它大田农作物、露地蔬菜和牧草为辅助测试作物。现有人员9名，高级职称以上技术人员4名，硕士以上学历技术人员5名。
2017年正式承接农业部及企业的测试任务，截止2019年共完成小麦、大麦、玉米、向日葵等作物的测试样品1272份，收集、评价并保存资源2197份，技术服务对象涵盖内蒙古、甘肃、宁夏、新疆、北京、河北、河南、安徽、山西9省（自治区）的150多家企业及科研院所。
验收专家组对建设工程、试验田、仪器设备及管理运行情况进行了实地查看，听取了项目建设及运行情况汇报，查阅了项目建设资料，认为农业部植物新品种测试巴彦淖尔分中心建设项目工程布局合理，建设内容基本按照项目初步设计批复计划实施完成，建设质量达到设计要求。项目实施中严格执行了法人制、招投标制、合同制、监理制，管理制度完善。项目设立专帐管理，专款专用，并经第三方审计。项目档案管理比较规范，并按要求进行分类管理。项目建成后，开展了玉米、向日葵、小麦、大麦等农作物品种DUS测试，为相关企业及科研院所提供了DUS测试技术服务，2019年获得农业农村部高分值评估。该项目符合验收标准，通过验收。